С 1999 года Керченский Союз Казаков, основанный в 1993 г., окормляется о.Алексием (Якушевым). Со временем стала ясна необходимость создания собственного храма. В 2000 году было принято решение о создании войскового храма Керченского Союза Казаков. 23 февраля 2000 г. была зарегистрирована учрежденная казаками церковная община в честь Святого благоверного князя Димитрия Донского. 1 июня 2001 г. по решению сессии Керченского городского совета под храм было передано здание бывшего клуба пос. Капканы (здание построено в 1935 г., реконструировано предположительно в 50-е годы). По промыслу Божию этот день совпал с днем престольного праздника Святого благоверного князя Димитрия Донского.

Первая Божественная литургия была отслужена 3 ноября 2001 г., в том году этот день совпал с Дмитриевской родительской субботой.

С 2001 года по 2008 год настоятелям храма был о.Алексий Якушев, с 2008 по 2012 в храме поменялось четыре священника, 11 января 2012 г. на приход был назначен настоятелем о.Сергий Краплин.